除了培养儿童学习的兴趣和能力外，卢梭认为，少年期教育的另一个重要任务就是培养孩子独立思考和判断的能力。
卢梭认为，少年期教育的任务，首先是要避免孩子受到错误思想的干扰。他说，“你要始终记住，我所施行的教育，其精神不是要教孩子很多的东西，而是要让他头脑中获得完全正确的和清楚的观念。即使他一无所知，那也没有关系，只要他未受欺骗就行了；我之所以向他的头脑中灌输真理，只是为了保证他不在心中装填谬误。理智和判断力的发展是很慢的，然而偏见却大量地产生，需要预先防备的正是种种的偏见”①。为了使一个青年能够成为明智的人，就必须培养他有自己的看法，而不能硬是要他采取我们的看法。否则的话，一旦儿童养成了盲目听信他人的习惯，无法进行独立的思考与判断，那他就永远无法成为一个明智的人。早在谈论儿童早期的教育时，卢梭就说：“我们最初的哲学老师是我们的脚、我们的手和我们的眼睛。用书本来代替这些东西，那就不是在教我们自己推理，而是在教我们利用别人的推理，在教我们老是相信别人的话，而不是自己去学习。”②如果老是由你去指点他，老是由你告诉他“来呀，去呀，休息呀，做这个，不做那个呀，”结果，你用这个方法的确是会使他变成一个傻子的。如果你的头脑常常去指挥他的手，那么,他自己的头脑就会变得没有用处。