由此可见，卢梭看到了感性认识的不足，主张把感性认识上升为理性认识，看到了感觉和理性之间的联系，这是符合我们认识事物的一般规律的。不过，在具体论述感觉和理性的关系时，卢梭又把它们分成了两个截然不同的阶段，认为感觉和理性的发展分别对应儿童的不同阶段，在儿童的早期发展中，儿童身体的发展要先于理智的成熟，这时他的理性一直是处于睡眠状态的，只有到了12岁以后，才会苏醒。这种简单地把感觉和理性分成两个阶段的观点，没有认识到人的认识过程的复杂性，影响了他的科学性。
而且，卢梭的感觉认识论并不彻底。他把理性看做是上帝赋予人类的一种天性，认为理性思维能力是人的心灵中所固有的一种能力，这就带上了天赋观念论的色彩。同时他还认为，我们的理性常常会受到欲望的蒙蔽，会受到私利的诱惑，从而误入歧途。因为理性只有认识善恶的作用，只能起情感的辅助作用，没有良心它便不能向善，所以，理性必须由良心来统率，进而由理性去指导自由，只有这样，我们的天性才能保持纯善。他还认为，“要想最恰当地用我们的理性，最好的办法莫过于使它听从于上帝的旨意。”①因为上帝是不需要任何前提、命题、推理的最高智慧，它是直觉的。他认为自然是不会有错误的，错误是发生在人的理性上，是在人的主观判断中，“理性欺骗我们的时候太多了，我们有充分的权利对它表示怀疑”。①于是卢梭又用良心将理性给取代了，因为在他眼里良心从来没有欺骗过我们，它是人类真正的向导。