张鹏翮体会到康熙皇帝未雨绸缪之意，在康熙四十一年(1702)正月提出八项保固防险工程，以迎接春汛、秋汛两汛的考验，但对洪泽湖上流未曾虑及，结果盱眙等三县于春汛时被淹。伏秋水涨，徐州至海口黄河西岸堤坝及山阳至邵伯运河西岸堤坝乃至高家堰大堤，先后发生数次险情，幸而抢救及时，未致成灾。同年九月，张鹏翮奏报秋水情形，康熙皇帝从中得知，按他指示在清口附近所筑挑水坝(御坝)在这次防汛中发挥了巨大作用，其他各处工程亦皆保固，甚感欣慰。
康熙四十二年(1703)正月十六日至三月十五日，康熙皇帝以淮黄告成，进行第四次南巡。这次南巡主要是对张鹏翮三年来所建河工项目进行验收。检验结果，大都很满意，仅在微小地方做些调整和补充。如至桃源烟嫩、龙窝等地，见顶冲危险，命增筑挑水坝，个别卑矮堤工也命增高，到中河仲庄闸口，见其与清口相对，命改由杨家庄出口。回銮时，巡视了高家堰、翟家坝等处堤工，见王公堤单薄，命加帮高厚；高家堰大坝个别有残缺石工，命即兴修；又命选职衔稍大、身家殷实之人担任高家堰防险。到清口，命将西坝加长数丈。赐张鹏翮御制《河臣箴》和《览淮黄成》诗。诗中写道：“使清引浊须勤慎，分势开疏在不荒。虽奏安澜宽旰食，诫前善后奠金汤。”意在告诫他不要麻痹大意，要继续努力做好善后工作。